Відділ епідеміологічного нагляду (спостереження) та профілактики інфекційних хвороб
Відділ епідеміологічного нагляду (спостереження) та профілактики неінфекційних хвороб
Відділ імунопрофілактики
Відділ інфекційного контролю та антимікробної резистентності
Відділ безпеки середовища життєдіяльності
Відділення дезінфекційних заходів
Відділ готовності та реагування на надзвичайні ситуації
Санітарно-карантинний відділ
Відділ організації лабораторної роботи, системи управління якістю та метрологічного забезпечення
Вірусологічна лабораторія
Бактеріологічна лабораторія
Лабораторія особливо-небезпечних інфекцій
Паразитологічна лабораторія
Санітарно-гігієнічна лабораторія
Радіологічна лабораторія
Лабораторія електоромагнітних полів та інших фізичних факторів
Відділ бухгалтерського обліку та звітності
Фінансово-економічний відділ
Відділ кадрового забезпечення
Відділ правового забезпечення
В.о. начальника відділу
Грищенко Олександр Вікторович
Відділ організаційного забезпечення та документообігу
Відділ господарського забезпечення
Начальник відділу
Соболь Дмитро Анатолійович
Відділ інформаційних систем та захисту інформації
Відділ комунікації та інформаційно-роз'яснювальної роботи